Die Harlekinwachteln leben, so wie die Afrikanischen Zwergwachteln, nomadisch. Sie ziehen in großen Scharen in Gebiete, in denen es geregnet hat und beginnen dort zu brüten, wo genügend Nahrung vorhanden ist. Sie erscheinen plötzlich in solchen Gebieten, brüten und verschwinden mit den erwachsenen Jungvögeln wieder. An der eigentlichen Aufzucht nimmt der Hahn nicht teil. Die Küken sind Nestflüchter und folgen kurz nach dem Schlupf der Mutter.
Die Hennen sind bei den Harlekinwachteln insgesamt heller und weniger kontrastreich gefärbt. Wie so oft im Tierreich ist diese Schlichtheit der beste Schutz vor Feinden, ganz besonders während der Brut und Aufzucht der Küken.